जौनपुर में कई प्रतिष्ठित अस्पताल हैं जो शहर और आसपास के क्षेत्रों के नागरिकों को उच्च गुणवत्ता की स्वास्थ्य सेवाएं प्रदान करते हैं। सरकारी अस्पतालों से लेकर प्राइवेट नर्सिंग होम तक, यहां आपातकालीन सेवाएं, प्रसूति सेवाएं, सर्जरी और विशेषज्ञ परामर्श उपलब्ध हैं।