जौनपुर की शैक्षिक विरासत अत्यंत समृद्ध है। वीर बहादुर सिंह पूर्वांचल विश्वविद्यालय जैसे संस्थान यहाँ हैं। शहर में सीबीएसई, यूपी बोर्ड स्कूल, डिग्री कॉलेज और प्रोफेशनल संस्थान प्राथमिक से स्नातकोत्तर स्तर तक शिक्षा प्रदान करते हैं।